运输署于下午1时37分左右表示，接获港铁公司通知，由于小蚝湾车厂附近信号设备故障，机场快线及东涌线的列车服务受到影响。及至下午约2时03分，事故已经妥善处理，列车班次逐步回复正常。

警方亦曾接获港铁职员报案，指欣澳站附近信号故障，来回方向列车受影响。