新皇岗口岸启用后首个周日，适逢重阳节三日假期，今日（18日）大批旅客离境，中午时分，过关闸口大排长龙，有人报称等候两小时仍未成功过关。保安局表示，自上午11时起，北上旅客人流显著增加，并指中午12时至下午2时期间，有约19,000名旅客经皇岗口岸离境前往内地，较皇岗口岸／落马洲管制站过往同期上升835%；最高峰一小时，更有9,728人次离境。
保安局指，入境处已即时开放L5层离境大堂所有过关通道及柜位，并联同警务处于L2及L5层实施人流分流及管制措施，旅客最高轮候时间需75分钟。局方称，是次面对突增人流，各项预案得以及时启动，整体运作大致畅顺。

新皇岗口岸开通后首个周日人头涌涌，下午时分，过关闸口大排长龙，有人报称等候两小时仍未成功过关。不少市民在社交媒体发帖指现场管理混乱，不仅现场工作人员“一问三不知”，甚至出现旅客“找不到队尾”及被迫折返重新排队等乱象。

保安局表示，皇岗口岸上午约11时起，北上旅客人流显著增加。在中午12时至下午2时期间，约有19,000名旅客经皇岗口岸离境前往内地，较皇岗口岸／落马洲管制站过往同期上升835%。在下午1时至2时的最高峰时段，更有9,728人次于一小时内离境，较皇岗口岸／落马洲管制站过往同期上升899%。

保安局指，入境事务处已即时开放L5层离境大堂所有过关通道及柜位，以加快疏导人流，并联同警务处于L2及L5层实施人流分流及管制措施。旅客于上述高峰时段进入皇岗口岸，在L2层轮候人流分流安排的时间约为30至45分钟，而在L5层离境大堂的轮候时间则维持在30分钟以内，即最高轮候时间合共达75分钟。

L2层人流分流管制措施已于下午2时10分取消　L5层轮候时间下午2时40分缩短至15分钟内

局方续指，至今日下午约2时起，离境高峰期逐渐过去。L2层的人流分流管制措施已于下午2时10分取消，而L5层离境大堂的轮候时间亦于下午2时40分缩短至15分钟以内。

局方说，相关部门早前在皇岗口岸进行约二万人参与的大型演练时，已就高峰时段可能出现的大量旅客人流进行评估，并制定分流、排队管理及跨部门协调安排，“是次面对突增人流，各项预案得以及时启动，整体运作大致畅顺”。