“部门首长责任制”不涵盖全部常秘，只包括教育局及房屋局常秘，有政界中人质疑是否漏洞。立法会前主席曾钰成认为教育署是政府内部仍存在的部门，由教育局常秘出任，故常秘是教育署主管，理解教育局常秘会跌入“部门首长责任制”范围，惟他不清楚其他局常秘的分工是否主管部门的具体工作，难以评论。

不过，他认为原则是部门主管是署长，而不是常秘，“假如屋宇署行政出问题，首先署长问责，但常秘由署长睇，常秘要负几多责任呢？系另一个问题”，建议政府明确列出甚么是责任制下涵盖的部门首长。

部门首长责任制不包全部常秘　曾钰成望清楚交代首长定义

“部门首长责任制”之中第二级调查提到如部门出现严重问题，或涉及广泛或重复性的系统问题，或有迹象显示问题可能涉及部门首长的角色时，调查由专为责任制设立的调查小组负责，查找不足与厘清责任。公务员事务局指，将有超过60名高级公务员受规管，包括两名兼任部门行政主管的决策局常任秘书长，即教育局及房屋局，其余常秘则不受影响，惟倘常秘牵涉问题，一样会调查常秘。

曾钰成在个人网台节目表示，部门首长责任制目的是提升部门效能，重点在于执行力，如果政策本身有问题，就不是负责执行政策的部门首长有问题。他认为原则是部门主管是署长，而不是常秘，“假如屋宇署行政出问题，首先署长问责，但常秘由署长睇，常秘要负几多责任呢？系另一个问题”。他说公众期望责任制有更多具体细节交代，包括若套用现有的宏福苑火灾等事件上，会如何处理问责。

被问到文件是否有需要清楚交代不包括全部常秘的原因，曾钰成指政府应该有一份文件解释何谓部门首长责任制，以及部门首长的定义，不限于现在给予立法会的文件内容，“既然系新嘅嘢，行政长官经过反复思考嘅新制度，系咪应该有一份完整说明呢”，一定要列出部门首长释义，其他各级官员都受规管，“如果零零零舍舍有常秘根本唔符合部门首长定义，亦唔系辅助部门首长的行政工作”，便自然不受责任制规管。

若应调查的事件无查　曾钰成：立法会可施加政治压力

署长的直属上司是常秘，被问到为何不是由常秘启动调查，而是由特首或司局长启动赋权公务员叙用委员会调查，曾钰成认同应该先由内部调查，如果不可行，才由政治问责官员启动调查。不过，如果出现立法会议员认为应调查的事件，而政府没有调查，他认为议员可以在立法会对政府施加政治压力，包括没约束力动议、质询，“政府要答㗎㖞，议员会问你点解”，认为问责性可体现在立法会。